Protein–RNA interactions for Protein: P23818

Gria1, Glutamate receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria1P23818 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gria1P23818 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gria1P23818 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gria1P23818 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gria1P23818 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gria1P23818 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gria1P23818 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Gria1P23818 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms