Protein–RNA interactions for Protein: P23336

Ggta1, N-acetyllactosaminide alpha-1,3-galactosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ggta1P23336 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ggta1P23336 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms