Protein–RNA interactions for Protein: P23198

Cbx3, Chromobox protein homolog 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx3P23198 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cbx3P23198 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Cbx3P23198 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms