Protein–RNA interactions for Protein: P21271

Myo5b, Unconventional myosin-Vb, mousemouse

Predictions only

Length 1,818 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5bP21271 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Myo5bP21271 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Myo5bP21271 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms