Protein–RNA interactions for Protein: P20937

Klra1, T-cell surface glycoprotein YE1/48, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klra1P20937 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Gm26787-201ENSMUST00000180474 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Klra1P20937 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Klra1P20937 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms