Protein–RNA interactions for Protein: P20444

Prkca, Protein kinase C alpha type, mousemouse

Predictions only

Length 672 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcaP20444 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
PrkcaP20444 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
PrkcaP20444 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms