Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ntf3P20181 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ntf3P20181 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms