Protein–RNA interactions for Protein: P18608

Hmgn1, Non-histone chromosomal protein HMG-14, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn1P18608 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Hmgn1P18608 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Hmgn1P18608 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms