Protein–RNA interactions for Protein: P17950

Ier2, Immediate early response gene 2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ier2P17950 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ier2P17950 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ier2P17950 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ier2P17950 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ier2P17950 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ier2P17950 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms