Protein–RNA interactions for Protein: P17533

Defa-rs1, Alpha-defensin-related sequence 1, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs1P17533 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Defa-rs1P17533 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defa-rs1P17533 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms