Protein–RNA interactions for Protein: P17125

Tgfb3, Transforming growth factor beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb3P17125 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Tgfb3P17125 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms