Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PrkceP16054 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
PrkceP16054 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
PrkceP16054 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
PrkceP16054 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PrkceP16054 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkceP16054 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkceP16054 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
PrkceP16054 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms