Protein–RNA interactions for Protein: P13011

Scd2, Acyl-CoA desaturase 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scd2P13011 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scd2P13011 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Scd2P13011 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scd2P13011 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scd2P13011 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scd2P13011 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scd2P13011 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scd2P13011 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scd2P13011 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Scd2P13011 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Scd2P13011 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scd2P13011 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd2P13011 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scd2P13011 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd2P13011 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scd2P13011 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scd2P13011 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd2P13011 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd2P13011 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd2P13011 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scd2P13011 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd2P13011 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Scd2P13011 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Scd2P13011 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Scd2P13011 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms