Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nid1P10493 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Nid1P10493 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nid1P10493 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms