Protein–RNA interactions for Protein: P0CG50

Ubc, Polyubiquitin-C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 734 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UbcP0CG50 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
UbcP0CG50 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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