Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Igsf6P0C6B7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms