Protein–RNA interactions for Protein: P0C5E4

Ptprq, Phosphatidylinositol phosphatase PTPRQ, mousemouse

Predictions only

Length 2,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprqP0C5E4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
PtprqP0C5E4 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms