Protein–RNA interactions for Protein: P09021

Hoxa5, Homeobox protein Hox-A5, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa5P09021 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Hoxa5P09021 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Hoxa5P09021 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms