Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spta1P08032 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spta1P08032 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Spta1P08032 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spta1P08032 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spta1P08032 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Spta1P08032 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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