Protein–RNA interactions for Protein: P03888

Mtnd1, NADH-ubiquinone oxidoreductase chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtnd1P03888 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Mtnd1P03888 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Mtnd1P03888 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms