Protein–RNA interactions for Protein: P02535

Krt10, Keratin, type I cytoskeletal 10, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt10P02535 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Krt10P02535 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Krt10P02535 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms