Protein–RNA interactions for Protein: P01633

Igk-V19-17, Ig kappa chain V19-17, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igk-V19-17P01633 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Igk-V19-17P01633 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Igk-V19-17P01633 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms