Protein–RNA interactions for Protein: O88838

Spsb2, SPRY domain-containing SOCS box protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spsb2O88838 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Spsb2O88838 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Spsb2O88838 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms