Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

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Length 300 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
F11rO88792 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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F11rO88792 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
F11rO88792 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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F11rO88792 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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F11rO88792 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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F11rO88792 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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F11rO88792 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
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F11rO88792 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
F11rO88792 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
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F11rO88792 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F11rO88792 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F11rO88792 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F11rO88792 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F11rO88792 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F11rO88792 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F11rO88792 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F11rO88792 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F11rO88792 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F11rO88792 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F11rO88792 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F11rO88792 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F11rO88792 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
F11rO88792 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
F11rO88792 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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