Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms