Protein–RNA interactions for Protein: O88667

Rrad, GTP-binding protein RAD, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RradO88667 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RradO88667 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RradO88667 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RradO88667 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RradO88667 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RradO88667 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
RradO88667 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RradO88667 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RradO88667 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RradO88667 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RradO88667 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RradO88667 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RradO88667 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RradO88667 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
RradO88667 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
RradO88667 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
RradO88667 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RradO88667 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RradO88667 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RradO88667 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RradO88667 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RradO88667 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RradO88667 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RradO88667 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RradO88667 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RradO88667 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
RradO88667 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
RradO88667 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RradO88667 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
RradO88667 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
RradO88667 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RradO88667 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms