Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Lmx1bO88609 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lmx1bO88609 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms