Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Cacng2O88602 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms