Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Dnmt3bO88509 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms