Protein–RNA interactions for Protein: O88322

Nid2, Nidogen-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid2O88322 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nid2O88322 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nid2O88322 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nid2O88322 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nid2O88322 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nid2O88322 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nid2O88322 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nid2O88322 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nid2O88322 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid2O88322 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid2O88322 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nid2O88322 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms