Protein–RNA interactions for Protein: O88199

Chst3, Carbohydrate sulfotransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst3O88199 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Chst3O88199 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Chst3O88199 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms