Protein–RNA interactions for Protein: O88174

Cd46, Membrane cofactor protein, mousemouse

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Length 365 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd46O88174 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd46O88174 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cd46O88174 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cd46O88174 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Cd46O88174 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Cd46O88174 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd46O88174 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd46O88174 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd46O88174 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd46O88174 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms