Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srpk1O70551 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srpk1O70551 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srpk1O70551 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srpk1O70551 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srpk1O70551 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srpk1O70551 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srpk1O70551 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srpk1O70551 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srpk1O70551 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Srpk1O70551 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srpk1O70551 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srpk1O70551 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srpk1O70551 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srpk1O70551 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Srpk1O70551 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Srpk1O70551 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms