Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Cbx4O55187 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Cbx4O55187 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms