Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Copb2O55029 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb2O55029 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb2O55029 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb2O55029 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb2O55029 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb2O55029 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb2O55029 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.8 ms