Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh16O54909 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh16O54909 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh16O54909 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh16O54909 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh16O54909 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Rdh16O54909 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rdh16O54909 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh16O54909 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh16O54909 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rdh16O54909 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh16O54909 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh16O54909 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Rdh16O54909 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Rdh16O54909 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rdh16O54909 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rdh16O54909 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
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Rdh16O54909 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Rdh16O54909 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Rdh16O54909 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rdh16O54909 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Rdh16O54909 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
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