Protein–RNA interactions for Protein: O35892

Sp100, Nuclear autoantigen Sp-100, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp100O35892 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Sp100O35892 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Sp100O35892 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp100O35892 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp100O35892 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Sp100O35892 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms