Protein–RNA interactions for Protein: O35464

Sema6a, Semaphorin-6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6aO35464 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Sema6aO35464 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sema6aO35464 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
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