Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccrl2O35457 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms