Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ppt2O35448 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ppt2O35448 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms