Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gfra3O35118 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gfra3O35118 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gfra3O35118 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gfra3O35118 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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