Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sec22bO08547 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sec22bO08547 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms