Protein–RNA interactions for Protein: O08546

U90926, Putative TNF-resistance related protein, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U90926O08546 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
U90926O08546 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
U90926O08546 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
U90926O08546 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
U90926O08546 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
U90926O08546 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
U90926O08546 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
U90926O08546 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
U90926O08546 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
U90926O08546 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
U90926O08546 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
U90926O08546 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
U90926O08546 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
U90926O08546 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
U90926O08546 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
U90926O08546 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
U90926O08546 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
U90926O08546 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
U90926O08546 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
U90926O08546 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
U90926O08546 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.5
U90926O08546 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.5
U90926O08546 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
U90926O08546 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.95□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms