Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
MsmbO08540 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
MsmbO08540 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
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