Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm20939L7N243 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms