Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm379J3QQ19 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm379J3QQ19 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms