Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 1700083H02Rik-201ENSMUST00000190526 637 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm26801-202ENSMUST00000193187 610 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm44845-201ENSMUST00000208773 335 ntBASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm33501-201ENSMUST00000209257 1193 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm34662-202ENSMUST00000220753 603 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Arxes1-201ENSMUST00000057625 1580 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 A530046M15Rik-201ENSMUST00000221778 1538 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.64□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Tmsb15b1-201ENSMUST00000113071 439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Rbm48-202ENSMUST00000121877 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 9430091E24Rik-201ENSMUST00000127301 1067 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 1700023C21Rik-201ENSMUST00000143247 389 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Vmn1r-ps18-201ENSMUST00000176901 876 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm4791-201ENSMUST00000178065 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm17983-201ENSMUST00000190766 594 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 A830092H15Rik-202ENSMUST00000195446 649 ntTSL 3 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 AC131743.3-201ENSMUST00000222099 662 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 9430031K09Rik-201ENSMUST00000222913 925 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 CT025523.1-201ENSMUST00000228318 694 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Acbd7-202ENSMUST00000228935 534 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm15594-201ENSMUST00000137958 2215 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 AC122539.3-201ENSMUST00000218355 1431 ntBASIC8.63□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Serpinb6c-202ENSMUST00000172184 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Tshr-201ENSMUST00000021343 1339 ntTSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC8.62□□□□□ -1.03
Gm21887J3QQ04 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms