Protein–RNA interactions for Protein: J3QPD3

Gm8356, Predicted gene 8356, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8356J3QPD3 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gm8356J3QPD3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm8356J3QPD3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms