Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms