Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm21972J3QN38 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm21972J3QN38 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms